Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms