Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIC2Q96JB3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms