Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim7Q923T7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim7Q923T7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim7Q923T7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim7Q923T7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim7Q923T7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim7Q923T7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim7Q923T7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim7Q923T7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim7Q923T7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim7Q923T7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim7Q923T7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim7Q923T7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim7Q923T7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim7Q923T7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim7Q923T7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms