Protein–RNA interactions for Protein: Q921W0

Chmp1a, Charged multivesicular body protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1aQ921W0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1aQ921W0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1aQ921W0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms