Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx4Q91YJ2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms