Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp3Q91W36 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms