Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacng8Q8VHW2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacng8Q8VHW2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms