Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms