Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccm2Q8K2Y9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccm2Q8K2Y9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccm2Q8K2Y9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccm2Q8K2Y9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccm2Q8K2Y9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccm2Q8K2Y9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccm2Q8K2Y9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccm2Q8K2Y9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccm2Q8K2Y9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccm2Q8K2Y9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccm2Q8K2Y9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccm2Q8K2Y9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccm2Q8K2Y9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccm2Q8K2Y9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms