Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1eQ8K202 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms