Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stx5Q8K1E0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx5Q8K1E0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms