Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PASD1Q8IV76 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms