Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.06■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
6030452D12RikQ8CD33 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.05■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.05■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.05■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.04■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
6030452D12RikQ8CD33 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms