Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vwc2Q8C8N3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms