Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc60Q8C4J0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc60Q8C4J0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc60Q8C4J0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc60Q8C4J0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc60Q8C4J0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc60Q8C4J0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc60Q8C4J0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc60Q8C4J0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc60Q8C4J0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc60Q8C4J0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc60Q8C4J0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc60Q8C4J0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc60Q8C4J0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc60Q8C4J0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc60Q8C4J0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms