Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall4Q8BX22 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms