Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc2Q8BKV1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms