Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem87bQ8BKU8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem87bQ8BKU8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms