Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms