Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg4bQ8BGE6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4bQ8BGE6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms