Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms