Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms