Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prima1Q810F0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prima1Q810F0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms