Protein–RNA interactions for Protein: Q80X59

Tmco5b, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5bQ80X59 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmco5bQ80X59 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmco5bQ80X59 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmco5bQ80X59 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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