Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms