Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc155Q80VJ8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms