Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Clec18aQ7TSQ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Clec18aQ7TSQ1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Clec18aQ7TSQ1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Clec18aQ7TSQ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Clec18aQ7TSQ1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Clec18aQ7TSQ1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Clec18aQ7TSQ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Clec18aQ7TSQ1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Clec18aQ7TSQ1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Clec18aQ7TSQ1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Clec18aQ7TSQ1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Clec18aQ7TSQ1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Clec18aQ7TSQ1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Clec18aQ7TSQ1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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