Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccp110Q7TSH4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccp110Q7TSH4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms