Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TwistnbQ78WZ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TwistnbQ78WZ7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms