Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms