Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp34Q6ZQ93 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms