Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Efr3bQ6ZQ18 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Efr3bQ6ZQ18 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Efr3bQ6ZQ18 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Efr3bQ6ZQ18 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Efr3bQ6ZQ18 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Efr3bQ6ZQ18 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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