Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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