Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms