Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms