Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf9bQ6NZA9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf9bQ6NZA9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf9bQ6NZA9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf9bQ6NZA9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf9bQ6NZA9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms