Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms