Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms