Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.4 ms