Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ctnna3Q65CL1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms