Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms