Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga3Q62470 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms