Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CcncQ62447 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CcncQ62447 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CcncQ62447 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CcncQ62447 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CcncQ62447 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CcncQ62447 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CcncQ62447 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CcncQ62447 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CcncQ62447 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CcncQ62447 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CcncQ62447 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms