Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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Trim28Q62318 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim28Q62318 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim28Q62318 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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