Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spock1Q62288 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms