Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
AtrxQ61687 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrxQ61687 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms