Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Dsg1aQ61495 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms