Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccne1Q61457 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccne1Q61457 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms