Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf4bQ61136 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prpf4bQ61136 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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