Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarb1Q61009 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarb1Q61009 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarb1Q61009 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarb1Q61009 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarb1Q61009 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarb1Q61009 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarb1Q61009 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarb1Q61009 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarb1Q61009 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarb1Q61009 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarb1Q61009 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarb1Q61009 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarb1Q61009 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarb1Q61009 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scarb1Q61009 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scarb1Q61009 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scarb1Q61009 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scarb1Q61009 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scarb1Q61009 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scarb1Q61009 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scarb1Q61009 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Scarb1Q61009 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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